Hola.
El sistema que uso yo para limpiar el ordenador (cosa que hago todo lo a menudo que puedo, ya que hago un uso intensivo de él) es utilizar un compresor de aire (de un amigo, de los que se usan para pintar), una vez desmontado el ventilador y el disipador de la CPU.
El chorro de aire a presión, mantenido a una distancia de seguridad de unos centímetros, hace desaparecer en el acto toda la suciedad.
Después aplico la pasta esa térmica y lo vuelvo a montar. De esa manera evito el típico pantallazo azul y posterior cierre.
Saludos.