Pues es raro lo que te pasa...si restaurando el sistema sigue igual, es raro; si pasas el antivirus y nada, es raro; prueba a pasar un detector de espías, el SpyBot, descargable desde aquí:
http://spybot-search-destroy.softonic.com/
Actualízalo, pues no sé si es la versión más reciente.
Cuando toques el registro, ten cuidado, que puedes cargarte el sistema entero.
No creo que se problema de temperatura del PC o de memoria, pues si fuera fallo de temperatura, nada más encender el ordenador, a los pocos minutos te empezaría a funcionar mal, dándote tirones, cuajándose, o a dar el típico pantallazo de Windows.
Y tampoco creo que sea problema del Firewall, pues el Firewall es para la red (que yo sepa).
Bueno, y si así no funciona, pfff, pues tendrás que hacer lo peor de lo peor: instalar desde el principio.
Pero estoy recordando, que a mí hace tiempo me salió el error de tener que reinstalar el MSTS, vamos el último que has puesto, yyyy directamente reinstalé, sin perder las carpetas de los trenes, consist y demás.
Que tengas suerte
.
Línea clausurada.